綠色和平組織日本分部的聲譽最近有些下滑，新聞報導 [1]指出，為突顯鯨豚研究船員偷偷販賣鯨肉，該組織竊取鯨肉做為犯罪證據，為取得好幾包鯨肉，該組織承認在未經許可情況下，於4月15日潛入東京一家快遞公司的配送中心。綠色和平組織共發現23.5公斤的鯨肉，價值約1000美元至3000美元，由「共同船舶會社」12名船員偷渡進口。
5月15日關於綠色和平組織揭發鯨肉事件的新聞報導
綠色和平組織的委任律師宣稱 [2]：「此次侵入私有領域行為並不違法，這是為了揭發竊取鯨肉事件」，這項說法顯然不為部落客所接受，質疑以犯罪揭發犯罪是雙重標準。
部落客清谷信一指出 [3][日文]：
捕鯨國家確實行事馬虎，但綠色和平組織的作為也不能出現在法治國家內。
若他們所言合理，以後我們為揭露綠色和平組織及律師的犯行，就闖入他們的辦公室，挾持成員與律師，逼迫他們認罪，這也會是「合法行為」。
在此案各種意見之中，很明顯綠色和平組織是犯罪團體，是生態恐怖份子，政府應依據「反破壞法」制裁他們，因為他們與極左派的暴力宗教組織「奧姆真理教」無異。
gootdk則閱讀日本維基百科 [4]對鯨豚研究捕撈的內容，並引述以下字句 [5][日文]：
條約要求各國有義務有效利用鯨豚研究捕撈的副產品。
除一般銷售之外，這些副產品還可以做為公用，如學校營養午餐等，收入所得則做為研究費用。
他也指出，10公斤至20公斤的鯨肉超過一般家庭所需，但緣色和平組織的立場仍不夠穩固：
縱然如此，也不代表社會就該容許綠色和平組織的行為。
這顯然是犯罪。
他們也降低社會對這間公司的信賴。
我希望雙方都受到審判，以避免法律出錯。
Hamayatii同意綠色和平組織的原則，但不同意作法 [6][日文]：
我贊同綠色和平組織部分看法，但為突顯捕鯨業違法，自己卻犯下強盜罪行，我不認同這種行為，他們說已準備好為自己的行為受罰，我可以理解，若堅稱要揭發某事，故這項行為不違法，這和為某項理想發動戰爭的邏輯根本一模一樣。
校對：Portnoy [7]